Diarrhées et prise d’antibiotiques : un cas particulier

Effet secondaire classique de la prise d’antibiotiques, la diarrhée est susceptible de compromettre l’efficacité du traitement notamment par son interruption précoce. Généralement bénigne, cette diarrhée post-antibiothérapie peut parfois cacher une infection intestinale plus sérieuse.

S’ils éradiquent les germes pathogènes responsables d’une infection, les antibiotiques peuvent également détruire certaines bactéries bénéfiques du microbiote intestinal et provoquer un déséquilibre plus ou moins important au sein de cet écosystème. Moins riche et moins diversifié, ce dernier ne parvient plus à assurer correctement ses fonctions protectrices².

Les antibiotiques, vraiment pas automatiques¹⁵  !

Entre 10 et 30 % des patients traités par antibiotiques constatent une modification de leur transit intestinal dans les 3 à 5 jours suivant le début de leur traitement, le plus souvent sous forme de diarrhée¹⁶. La plupart du temps, cette diarrhée est purement fonctionnelle, provoquée par la dysbiose qu’engendre la prise d’antibiotiques. Généralement sans fièvre, sans gravité et transitoire, elle régresse à l’arrêt de l’antibiothérapie ou dans les semaines qui suivent. Cependant la dysbiose qui débute dès les premières 24h du traitement antibiotique dure jusqu’à six semaines après l’arrêt de celui-ci. De nouveaux micro-organismes, proches des souches initiales mais pas nécessairement identiques, recolonisent lentement les intestins et créent un nouvel équilibre, même s’il demeure souvent incomplet.

Un boulevard pour les pathogènes

Mais parfois, la couche de mucus, véritable forteresse de nos intestins, est si fragilisée que l’organisme devient plus vulnérable aux pathogènes. Dans 10 à 20 % des cas, la diarrhée résulte de la colonisation du microbiote par Clostridium difficile. En effet, cette bactérie est très répandue dans les hôpitaux et les établissements hébergeant des personnes âgées dépendantes, particulièrement vulnérables : en institution, jusqu’à 20 % des résidents (50 % des patients lors des longs séjours) peuvent héberger cette bactérie dans leurs intestins sans avoir de symptômes (porteurs asymptomatiques). Si la plupart des diarrhées à C. difficile cessent avec l’arrêt des antibiotiques, des formes plus sévères peuvent survenir (colite pseudomembraneuse et colite fulminante, notamment chez les plus de 65 ans¹⁷). Aux États-Unis par exemple, cette infection est responsable d’environ 30 000 décès/an¹⁸. Les familles d’antibiotiques souvent incriminées sont connues : les pénicillines, certaines générations de céphalosporines, les fluoroquinolones et la clindamycine. Un cycle délétère qui pourrait bien conférer à la greffe de selles (transplantation du microbiote d’un individu sain dans le tube digestif du malade) un statut d’alternative thérapeutique aux antibiotiques pour repeupler le microbiote et restaurer la barrière intestinale.