Gastroentérite infectieuse

Qu’est-ce que la gastroentérite infectieuse ? Quel est le lien avec le microbiote intestinal ?

La gastroentérite est une maladie diarrhéique, avec des symptômes souvent impressionnants qui disparaissent rapidement dans la plupart des cas⁴. Un déséquilibre du microbiote intestinal est observé chez les patients atteints⁵. Celui-ci peut persister après la résolution de l’infection, et être associée à un risque accru de développer des troubles chroniques⁶.

Généralement bénigne dans les pays occidentaux, la gastroentérite infectieuse est une des principales causes de mortalité dans les pays en voie de développement, particulièrement chez les enfants de moins de 5 ans⁴, où elle est un problème majeur de santé public puisqu’elle représente 10% des causes de décès chez les enfants¹. Le plus fort taux de mortalité se trouve dans les pays en voie de développement⁸ où l’hospitalisation est souvent⁹ liée aux cas graves de déshydratation qu’elle engendre. Sa cause ? L’ingestion d'un microorganisme pathogène (sidenote: Pathogène Un pathogène est un microorganisme qui cause, ou peut causer, une maladie. Pirofski LA, Casadevall A. Q and A: What is a pathogen? A question that begs the point. BMC Biol. 2012 Jan 31;10:6. )  : – un virus -c’est le cas le plus fréquent-, il s’agira alors d’une gastroentérite virale.

Le rotavirus est d’ailleurs l’un des principaux virus responsables des gastroentérites virales dans le monde et des diarrhées mortelles chez les enfants dans les pays en voie de développement, ceci malgré la disponibilité d’un vaccin¹⁰. D’autres virus peuvent bien sûr être responsables (norovirus, adénovirus...)^4. Mais la gastroentérite peut être aussi provoquée par une bactérie (gastroentérite bactérienne) ou un parasite, particulièrement lors d’un voyage⁷. Néanmoins, il s’avère que le pathogène est rarement confirmé¹¹.

La contamination se fait via des aliments ou de l’eau contaminés, ou directement par un contact physique d’un individu à un autre aggravé par de faibles mesures d’hygiènes⁶. Les données faisant état de l’association entre le microbiote intestinal et la gastroentérite sont encore très limitées. Néanmoins, on observe un déséquilibre intestinal (dysbiose (sidenote: Dysbiose La « dysbiose » n’est pas un phénomène homogène : elle varie en fonction de l’état de santé de chaque individu. Elle est généralement définie comme une altération de la composition et du fonctionnement du microbiote, provoquée par un ensemble de facteurs environnementaux et liés à l’individu, qui perturbent l’écosystème microbien. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. ) ) chez les patients pendant l’infection, quelle qu’en soit la cause^5,12,13. Des études rapportent que les enfants souffrant de gastroentérite virale sévère et compliquée, et particulièrement ceux infectés par le rotavirus, ont une diversité réduite au sein de leur microbiote intestinal comparativement aux enfants sains¹⁴. Enfin, d’autres études suggèrent que les modifications du microbiote intestinal peuvent persister sur le long terme et pourraient avoir des conséquences néfastes sur la santé, en favorisant notamment le développement d’un syndrome de l’intestin irritable¹⁵. Mais les données actuelles sur la contribution du microbiote intestinal dans le développement, les complications et l’évolution de la maladie nécessitent de plus amples investigations.

Des symptômes parfois impressionnants mais qui ne durent pas longtemps

En plus des diarrhées (définie par au moins 3 émissions de selles molles ou liquides dans une journée⁶), d’autres symptômes peuvent apparaître comme des nausées, des vomissements, des crampes abdominales, de la fièvre ou encore de l’anorexie¹⁶. Les symptômes de la gastroentérite virale durent généralement moins d’une semaine, en s’améliorant le plus souvent au bout de 1 à 3 jours⁴. Une attention particulière doit être portée aux enfants, personnes âgées et immunodéprimées, qui sont plus à risque de souffrir de déshydratation⁴. Dans certains cas, le médecin peut être amené à vous prescrire des examens complémentaires (analyse des selles, bilan sanguin etc..) pour écarter d'autres pathologies⁴.

Les antibiotiques souvent inutiles, voire contre-productifs 

Quelle que soit la cause de la gastroentérite infectieuse, le traitement est symptomatique⁴. En cas de diarrhée, la réhydratation constitue le principal traitement⁶. Loin d'être indispensable, le traitement antibiotique ne se justifie que si la cause bactérienne de la diarrhée est établie¹¹. Lorsque l’origine est essentiellement virale, les antibiotiques pourraient même s'avérer contre-productifs¹¹ ! A l'inverse, la prise de probiotiques, qui ont pour objectif de restaurer le microbiote intestinal, pourrait limiter l'importance et la durée des symptômes^7,17.

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