Le microbiote pulmonaire

Santé pulmonaire

Pourquoi le microbiote pulmonaire est-il si important pour la santé ?
Pendant longtemps les chercheurs pensaient qu’un poumon sain était un poumon stérile¹. Faux ! La richesse du microbiote pulmonaire est devenue une réalité médicale il y a seulement une dizaine d’années². Et depuis, il peine à livrer ses secrets…

A propos de cet article

Publié le 17 août 2021

Mis à jour le 25 juin 2024

Qu’est-ce que le microbiote pulmonaire ?

A la différence de son grand frère le microbiote intestinal, le microbiote pulmonaire n’a été étudié que très récemment. Ce retard s’explique en partie par la difficulté à obtenir des échantillons et à accéder à l’organe, deux opérations qui nécessitent souvent une méthode invasive³. De plus, le risque de contamination par les bactéries des voies respiratoires supérieures constitue un réel enjeu⁴. La première mise en évidence d’une flore pulmonaire remonte à 2010⁵, et depuis, très peu d’études ont été réalisées pour décrypter le rôle des communautés de microorganismes y résidant³.

Néanmoins, nous pouvons résumer les connaissances sur la composition du microbiote pulmonaire en trois points :

Une faible densité bactérienne⁵.
Une forte biodiversité. Chez les individus sains, les bactéries dominantes au niveau du poumon appartiennent aux genres Prevotella, Veillonella, Streptococcus, Neisseria, Fusobacterium et Haemophilus⁵. Son équilibre repose sur le rythme de respiration, entre les inspirations et les expirations⁶.
Une grande abondance de bactéries dites « anaérobies », c’est-à-dire se développant en l’absence d’oxygène⁷. Il s’agit des espèces bactériennes appartenant aux genres Fusobacterium, Porphyromonas, Prevotella et Veillonella⁷.

De plus, les bactéries ne sont pas les seuls microorganismes (sidenote: Micro-organismes Organismes vivants qui sont trop petits pour être vus à l'œil nu. Ils incluent les bactéries, les virus, les champignons, les archées, les protozoaires, etc… et sont communément appelés "microbes". What is microbiology? Microbiology Society. ) qui se développent au niveau du microbiote pulmonaire d’individus sains ! Des champignons (espèces appartenant aux genres Eremothecium, Systenostrema et Malassezia et à la famille Davidiellaceae) ainsi que des virus (espèces appartenant à la famille Anelloviridae, ainsi qu’un grand nombre de bactériophages (sidenote: Bactériophage Virus qui infecte les bactéries Scitable by Nature education_2014. Bacteriophage definition ) ) y résideraient également². Plus récemment, des découvertes ont mis en évidence la présence d’archées (sidenote: Archées Type de microorganismes (différents des bactéries), que l’on retrouve dans tous les environnements, et également des milieux extrêmes. Archaea. Microbiology Society ) au niveau pulmonaire⁸. Finalement, bien que ces micro-organismes prennent pleinement part au microbiote pulmonaire, un nombre limité de données sont actuellement disponibles.

Pourquoi le microbiote pulmonaire est-il un acteur majeur de notre santé ?

Le microbiote pulmonaire a un rôle clef pour le maintien de l’équilibre de la fonction pulmonaire. 4 grandes fonctions lui sont attribuées :

Il fonctionne comme une barrière contre les pathogènes, et aide à résister contre les infections respiratoires⁹, exactement de la même manière que le microbiote intestinal
Il joue un rôle défensif en participant activement à la stimulation de l’immunité innée et adaptative (sidenote: Immunité innée et adaptative Le corps humain assure sa protection grâce à 2 types de mécanismes de défense : l’immunité innée et l’immunité adaptative. L’immunité innée est la première ligne de défense contre les agents infectieux, c’est une réaction immédiate. Tandis que l’immunité adaptative intervient plus tardivement, mais procure une protection durable. Janeway CA Jr, Travers P, Walport M, et al. Immunobiology: The Immune System in Health and Disease. 5th edition. New York: Garland Science; 2001. Principles of innate and adaptive immunity. ) en cas d’infections^10,11
Il intervient dans la maturation du système immunitaire pulmonaire, afin de permettre entre autres une tolérance aux allergènes¹²
Il influence la morphologie des poumons, plus précisément le nombre d’alvéoles pulmonaire, d’après des travaux menés chez la souris¹³

Quelles sont les maladies associées à un déséquilibre du microbiote pulmonaire ?

Lorsque la composition du microbiote pulmonaire est déséquilibrée chez certains patients, une dysbiose (sidenote: Dysbiose La « dysbiose » n’est pas un phénomène homogène : elle varie en fonction de l’état de santé de chaque individu. Elle est généralement définie comme une altération de la composition et du fonctionnement du microbiote, provoquée par un ensemble de facteurs environnementaux et liés à l’individu, qui perturbent l’écosystème microbien. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. ) ¹⁴ apparaît, pouvant être associée à différentes maladies. À ce jour, les études scientifiques n’ont toujours pas permis de déterminer si la dysbiose est la cause ou la conséquence de ces maladies.

Examinons de plus près certains des troubles associés à une dysbiose pulmonaire :

les infections respiratoires hivernales, telles que le rhume, la grippe (le plus souvent d’origine virale) où l’on observe un déséquilibre de l’immunité pulmonaire, ainsi qu’une dysbiose pulmonaire et intestinale¹⁵
l’asthme¹⁶ : une maladie chronique du système respiratoire qui touche plus de 260 millions de personnes dans le monde¹⁷. Un déséquilibre du microbiote pulmonaire¹⁶, mais également intestinal¹⁸ et nasal¹⁹ est associé à cette pathologie
la mucoviscidose, une maladie génétique rare qui touche principalement les voies respiratoires et le système digestif²⁰
la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), caractérise par un rétrécissement progressif et une obstruction permanente des voies aériennes et des poumons, entraînant une gêne respiratoire¹⁶

L'axe intestins-poumons

Ces pathologies mettent en évidence la communication bidirectionnelle entre les intestins et les poumons, on parle alors d’« axe intestins-poumons »¹⁵. Le microbiote intestinal participe aux réponses immunologiques pulmonaires, et les pathologies pulmonaires peuvent également influer sur la composition du microbiote intestinal¹⁵. En effet, de nombreuses pathologies respiratoires sont souvent accompagnées de troubles gastro-intestinaux²¹, et, dans l’autre sens, la dysbiose intestinale est souvent associée à des pathologies pulmonaires¹⁶. L’implication de cet axe dans les pathologies pulmonaires constitue un domaine très prometteur²².

Comment prendre soin de son microbiote pulmonaire ?

Vous connaissez désormais le rôle important que joue le microbiote pulmonaire et l’axe intestin-poumon sur votre santé. Les chercheurs l’ont bien saisi et travaillent actuellement sur des études et des stratégies visant à prévenir ou guérir les infections pulmonaires^23,24.

Concernant la prévention des infections respiratoires hivernales, l’association de probiotiques avec des prébiotiques a montré des résultats encourageants²⁵. Chez le nourrisson, certains probiotiques permettraient de prévenir les infections hivernales dès les premiers mois de vie²⁶. Enfin, quelques études réalisées chez des étudiants ont montré l’intérêt des probiotiques en traitement, pour diminuer significativement la durée des symptômes^27,28.

Toutes les informations contenues dans cet article sont issues de sources scientifiques autorisées. N’oubliez pas que ces informations ne sont pas exhaustives. Retrouvez ici la liste des études d’où ces informations ont été extraites.