Diarrhée associée aux antibiotiques

Comment les antibiotiques déséquilibrent-ils la flore intestinale ? 

Les antibiotiques, s'ils éradiquent les germes pathogènes (sidenote: Pathogène Un pathogène est un microorganisme qui cause, ou peut causer, une maladie. Pirofski LA, Casadevall A. Q and A: What is a pathogen? A question that begs the point. BMC Biol. 2012 Jan 31;10:6. ) responsables de votre infection, peuvent  également détruire certaines bactéries bénéfiques au sein de votre microbiote, provoquant  systématiquement un déséquilibre plus ou moins important au sein de cet écosystème. Ce phénomène, connu sous le terme de dysbiose (sidenote: Dysbiose La « dysbiose » n’est pas un phénomène homogène : elle varie en fonction de l’état de santé de chaque individu. Elle est généralement définie comme une altération de la composition et du fonctionnement du microbiote, provoquée par un ensemble de facteurs environnementaux et liés à l’individu, qui perturbent l’écosystème microbien. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. ) , serait à l'origine de la diarrhée associée aux antibiotiques, le  microbiote intestinal étant alors moins apte à remplir ses fonctions protectrices. Celle-ci peut toucher jusqu’à 35% des patients^1-3 et chez les enfants, ce pourcentage peut atteindre jusqu'à 80%¹.

De plus, le microbiote intestinal, malgré un certain degré de résilience (c’est-à-dire que sa composition  revient à une composition proche de celle qu’il avait avant le déséquilibre induit par les antibiotiques),  peut parfois ne pas se restaurer complètement^4,5. Des recherches récentes ont montré que les antibiotiques peuvent altérer la diversité et l'abondance des bactéries, et ce déséquilibre peut être  prolongé (généralement 8 à 12 semaines après l'arrêt du traitement)^1,6.

Dans la plupart des cas, une diarrhée sans autre symptôme  

La principale conséquence à court terme d’un traitement antibiotique est la modification du transit intestinal chez certains patients, qui se traduit le plus souvent par une diarrhée. Celle-ci est définie par  l’émission d’au moins trois selles très molles à liquides, dans les 24 heures suivant le début d’un  traitement antibiotique, ou jusqu’à 2 mois après son arrêt^7-9. L'incidence de la diarrhée associée aux  antibiotiques dépend de plusieurs facteurs (âge, contexte, type d'antibiotique, etc.). Dans la grande  majorité des cas, la diarrhée est d'origine fonctionnelle, c’est-à-dire associée au déséquilibre du  microbiote intestinal, et elle est généralement d'intensité légère à modérée¹. Les antibiotiques présentant le spectre le plus large d'activité antimicrobienne (c’est-à-dire qu’ils auront une action sur un  très grand nombre de bactéries) sont associés à des taux plus élevés d’apparition de diarrhée³. 

Cependant, dans 10 à 20% des cas, la diarrhée résulte d'une infection par Clostridioides difficile (C.  difficile): une bactérie qui peut devenir pathogène sous l’influence de certains facteurs, comme une prise d’antibiotiques par exemple, mais également un âge supérieur à 65 ans ou encore certaines pathologies associées³. La colonisation de cette bactérie dans le microbiote intestinal déclenche une  réaction inflammatoire, avec des conséquences cliniques allant d’une diarrhée modérée à des  symptômes beaucoup plus graves, voire la mort³.

L'arrêt des antibiotiques, le traitement le plus efficace ? 

La prise en charge de la diarrhée associée aux antibiotiques dépend des symptômes et de l’agent  pathogène (C. difficile par exemple)¹⁰. Dans le cas d’une diarrhée légère à modérée, le traitement repose  sur l'arrêt de l’antibiotique en cause (ou le remplacement par un antibiotique moins à risque de  provoquer une diarrhée), afin de permettre au microbiote de se restaurer et au patient de se  réhydrater¹⁰.

De nombreuses études ont montré l’intérêt des probiotiques pour permettre la reconstitution du microbiote intestinal : certains probiotiques ont une efficacité démontrée pour prévenir et traiter la diarrhée associée aux antibiotiques^{6, 11-12}. 
D’autres ont montré que leur prise pendant un traitement antibiotique réduit le risque de première infection à C. difficile ainsi que les infections récurrentes^13-15. Enfin, la transplantation de microbiote fécal qui consiste à implanter par voie naturelle un microbiote  sain chez un individu malade pour restaurer son écosystème microbien, est limitée pour l'instant aux cas  d'infections les plus graves : elle est uniquement indiquée dans le traitement des rechutes des infections  à la bactérie pathogène C. difficile^16,17.

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