Як тільки ми дивимося на мікроскопічний світ, що живе в нашому тілі, починають спливати певні слова. Ці слова не завжди чітко визначені, та не зажди вживаються належним чином. Тому необхідні дефініції.
Від родового поняття «флора»...
Термін «флора», безумовно, існує найдовше. Колись він стосувався в основному травної системи («кишкової флори») і згідно з медичним словником Ларусса, визначався як «сукупність мікроорганізмів, які зазвичай живуть у кишечнику». У той час вважалося, що кишкова флора містить переважно бактерії1. Тому, коли використовувався термін «флора», він, як правило, стосувався популяції бактерій, що живуть у кишечнику.
... до сучасного терміну «мікробіота»
З розвитком науки, виявилось що такий погляд на флору був надто спрощеним. З одного боку, наша травна система містить набагато більше, ніж просто бактерії. Віруси, гриби (включно з дріжджами) і паразити також роблять травну систему своїм домом2.
(і ні, сеча не є стерильною!) все має свою флору.…3
Поступово у вжиток увійшов інший термін — «мікробіота». Цей термін однозначно належати до всіх спільнот мікроорганізмів (а не тільки бактерій). «Мікробіота» завжди супроводжується прикметником, що вказує на її місце розташування (мікробіота шкіри, мікробіота порожнини рота тощо), оскільки кожна мікробіота має свій характерний набір мікроорганізмів.
А як щодо «мікробіому»?
Іноді різниця висить на волосині, а точніше на відмінності в кілька літер. Дійсно, лише дві букви відділяють «мікробіоту» від «мікробіому». І все ж ці два терміни — хибні друзі. Перший позначає популяцію бактерій, вірусів тощо, що мешкають у певній ділянці нашого тіла, а друге стосується чогось зовсім іншого: генетичного матеріалу цієї спільноти, взятого в цілому, іншими словами все, що мікроорганізми можуть робити (виробляти конкретні молекули, робити конкретні типи мембран). Уявіть, що всі мікроорганізми, які складають мікробіоту, поміщають у блендер, тим самим стираючи їхню індивідуальність і залишаючи лише генетичний матеріал отриманого мікробного супу. Якщо уявити село, то «мікробіота» — це список мешканців, а «мікробіом» — список того, що ці мешканці колективно вміють робити (виготовляти хліб, будувати будинок тощо).
