Могут ли антибиотики влиять на резистентность микробиоты кишечника?

Медицинские исследования антибиотиков ограничены тем, что обычно они проходят с участием госпитализированных пациентов, получающих многочисленные лекарственные препараты. Существует множество вмешивающихся факторов (инфекции, лекарственные препараты, больничная среда, потенциальная иммуносупрессия), искажающих результаты исследований.

Единственным решением является проведение проспективных исследований с участием здоровых взрослых добровольцев вне больничных условий. Так, группа американских ученых изучила влияние четырех антибиотиков, в том числе, азитромицина (AZM), левофлоксацина (LVX), цефподоксима (CPD) и комбинации CPD и AZM, на микробиоту кишечника 20 здоровых добровольцев, которые были рандомизированы и включены в четыре группы, анализ образцов кала проводили до, во время и через два месяца после окончания применения антибиотиков (всего 15 процедур взятия образцов у каждого участника).  

Дисбиоз кишечника, вызванный применением антибиотиков

Первый вывод: антибиотики уменьшают содержание бактерий и их разнообразие. Изменения численности бактерий зависели от получаемого антибиотика.

• Так, на шестой день получения CPD или CPD + AZM у участников отмечалось более высокое содержание Bacteroidetes и Clostridium,
• тогда как LVX или AZM ассоциировались с преобладанием Firmicutes, таких как Eubacterium, Ruminococcus и Anaerostipes.

Кроме того, AZM (отдельно или в комбинации), который имеет длительный период полувыведения, задерживал восстановление содержания восьми видов бактерий и некоторых связанных с ними метаболических путей по сравнению с другими антибиотиками. 

Резервуар генов резистентности 

Другим эффектом антибиотиков было появление долговременного резервуара генов резистентности у добровольцев, получавших CPD, AZM и CPD + AZM, в отличие от тех, кто получал LVX. Однако, что более важно, измененный состав их резистома приводил к увеличению содержания трех генов (tetO, cfxA и tet40), два из которых не придают устойчивости к применяемым антибиотикам. Следовательно, нарушения микрофлоры, связанные с применением антибиотиков, могут создавать благоприятные условия для роста бактерий с широкой устойчивостью. Например, Bacteroides, которые выживают после лечения CPD, вероятно, с помощью гена резистентности к ß-лактамазам cfxA могут создавать среду с низким разнообразием и высоким содержанием Bacteroides, что способствует росту патогенов, таких как Enterobacter. Даже короткие курсы антибиотиков могут привести к приобретению или закреплению различных генов резистентности.