МИКРОБИОТА В КОНТЕКСТЕ ПАНДЕМИИ COVID-19

Covid-19

ОБЗОРНАЯ СТАТЬЯ

^{Проф. Консейсао Кальяу (Conceição Calhau)
Медицинская школа NOVA, Новый университет Лиссабона, Португалия}
^{Проф. Педро Повоа (Pedro Povoa)
Медицинская школа NOVA, Новый университет Лиссабона, Португалия; Отделение интенсивной терапии, Больница Сан-Франциско Ксавье, Лиссабон, Португалия; Центр клинической эпидемиологии Оденсе, Университетская больница, Дания}

Об этой статье

публикация 18 июля 2022

Обновлять 18 июля 2022

Разнообразие микробиоты кишечника было впервые упомянуто в качестве прогностического биомаркера тяжести Covid-19. Изменения микробиоты — надежный биомаркер в контексте Covid-19, который открывает новые грани патогенеза этого заболевания, подчеркивает важность его профилактики и предлагает новые возможности лечения. В 2020 году новый коронавирус серьезно затронул жизнь пожилых людей и пациентов с ожирением, артериальной гипертензией и сахарным диабетом [1]. Важно отметить, что у всех этих пациентов был выявлен дисбиоз [2, 3].

МИКРОБИОТА КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19

Поскольку кишечная микробиота играет ключевую роль в формировании иммунитета и развитии воспаления, авторы попытались оценить связь между изменениями в составе микробиоты и особенностями клинического течения Covid-19 [4]. Было проведено национальное многоцентровое перекрестное исследование с участием 115 пациентов с Covid-19, которых разделили на группы с учетом 1) места выздоровления от Covid-19 (на дому, в обычном стационаре или отделении интенсивной терапии) и 2) особенностей течения Covid-19 (бессимптомное, легкое/умеренное или тяжелое). У тяжелых пациентов отмечались глубокие изменения в составе микробиоты кишечника по сравнению с теми, чье заболевание протекало легко или умеренно в условиях домашней изоляции или обычного стационара (рисунок 1). Эти изменения включали: 1) более низкое общее микробное разнообразие кишечника; 2) более низкое содержание полезных бутират-продуцирующих бактерий, таких как Roseburia и Lachnospira; 3) более низкое соотношение Firmicutes/Bacteroidetes; 4) более высокое содержание Proteobacteria. Также в образцах кала пациентов были обнаружены вирусные частицы, что следует учесть в противоэпидемических рекомендациях [5, 6]. В других публикациях отмечается, что низкое разнообразие микробиоты может быть прогностическим биомаркером более тяжелого течения заболевания [7-9].

МИКРОБИОТА ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19, НАХОДЯЩИХСЯ В КРИТИЧЕСКОМ СОСТОЯНИИ

Не так давно считалось, что здоровые легкие стерильны. Однако результаты изучения микробиоты показали, что это не так. Легкие также колонизированы бактериями, но в очень малой степени по сравнению с кишечником [10]. Разные отделы дыхательных путей (ротоглотка, трахея и бронхи, легкие) отличаются составом микробиоты, что связано с источниками колонизации, скоростью заселения и элиминации микроорганизмов. Считается, что основным источником колонизации является полость рта [11]. Недавние исследования у тяжелых пациентов с Covid-19 показали, что дисбиоз микробиоты дыхательных путей (по данным анализа жидкости, полученной п р и б р о н х о а л ь в е о л я р н о м л а в а ж е ) а н а л о г и ч е н д и с б и о з у , н а б л ю д а е м о м у п р и и н ф е к ц и я х н и ж н и х д ы х а т е л ь н ы х путей, например, пневмонии [12, 13]. Кроме того, в легких умерших пациентов чаще всего обнаруживали Acinetobacter, распространенный грамотрицательный неферментирующий патоген, вызывающий тяжелую пневмонию у пациентов ОИТ, находящихся на искусственной вентиляции легких (ИВЛ) [14]. У части умерших пациентов в ротовой полости выявляли тех же самых патогенов, что и в легких [15]. Авторы показали, что в результате иммунной дисрегуляции при Covid-19 повышается риск внутрибольничных инфекций, особенно ИВЛ-ассоциированной пневмонии, что также подтверждается результатами нескольких э п и д е м и о л о г и ч е с к и х и с с л е д о в а н и й . У п а ц и е н т о в с C o v i d - 1 9 р и с к И В Л - ассоциированной пневмонии был в два раза выше, чем у пациентов без Covid-19 [16].

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Исследования микробиоты при Covid-19 открывают перспективы для разработки терапевтических вмешательств (пробиотики, пребиотики и пр.), направленных на коррекцию дисбиоза, наблюдаемого у тяжелых пациентов с Covid-19. Ожидается, что эти вмешательства увеличат общее бактериальное разнообразие и преобладание комменсальных бактерий, способствуя подавлению чрезмерного роста условно- патогенных микроорганизмов. Эти исследования также могут открыть путь к разработке эффективных вакцин для профилактики Covid-19, поскольку одним из известных факторов, влияющих на эффективность вакцин, является микробиота кишечника.

Источники

^{1 Petrakis D, Margină D, Tsarouhas K, et al. Obesity ‑ a risk factor for increased COVID‑19 prevalence, severity and lethality. Mol Med Rep 2020; 22: 9-19.}

^{2 Finlay BB. Are noncommunicable diseases communicable? Science 2020; 367: 250-1.}

^{3 Leocádio PCL, Oriá RB, Crespo-Lopez ME. Obesity: More Than an Inflammatory, an Infectious Disease? Front Immunol 2019; 10: 3092.}

^{4 Moreira-Rosário A, Marques C, Pinheiro H, et al. Gut microbiota diversity and c-reactive protein are predictors of disease severity in COVID-19 patients. Front Microbiol 2021; 12: 705020.}

^{5 Guo M, Tao W, Flavell RA, et al. Potential intestinal infection and faecal-oral transmission of SARS-CoV-2. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 2021; 18: 269-83.}

^{6 Wu Y, Guo C, Tang L, et al. Prolonged presence of SARS-CoV-2 viral RNA in faecal samples. Lancet Gastroenterol Hepatol 2020; 5: 434-5.}

^{7 Gu S, Chen Y, Wu Z, et al. Alterations of the gut microbiota in patients with coronavirus disease 2019 or H1N1 influenza. Clin Infect Dis 2020; 71: 2669-78.}

^{8 Yeoh YK, Zuo T, Lui GC-Y, et al. Gut microbiota composition reflects disease severity and dysfunctional immune responses in patients with COVID-19. Gut 2021 70, 698–706.}

^{9 Zuo T, Liu Q, Zhang F, et al. Depicting SARS-CoV-2 faecal viral activity in association with gut microbiota composition in patients with COVID-19. Gut 2021; 70: 276-84.}

^{10 Roux D, van Oort PM, Ricard JD, et al. Airway microbiome research: a modern perspective on surveillance cultures? Ann Transl Med 2017; 5: 445.}

^{11 Whiteson KL, Bailey B, Bergkessel M, et al. The upper respiratory tract as a microbial source for pulmonary infections in cystic fibrosis. Parallels from island biogeography. Am J Respir Crit Care Med 2014; 189: 1309-15.}