Quelle confiance accorder aux tests de microbiote intestinal à la maison ?

Après la mode des tests génétiques, une nouvelle vague d’auto-diagnostics émerge : les tests du microbiote intestinal.
L’idée est simple : analyser les bactéries présentes dans nos intestins à partir d’un échantillon de selles collecté via un « kit » de prélèvement et envoyé par La Poste.

On obtient alors directement un « profil de santé intestinale », sans passer par un médecin, pour détecter une éventuelle dysbiose. Autrement dit, ces bactéries sont transformées en indicateurs supposés refléter l’équilibre de la flore intestinale.
Un marché en plein essor, porté à la fois par les découvertes scientifiques des dernières années mettant en lumière les liens entre le microbiote et diverses maladies digestives et métaboliques, comme l’obésité ou certains cancers, ainsi qu’avec les troubles de la santé mentale, mais aussi son rôle essentiel dans le développement du système immunitaire – sans oublier les infox relayées par les réseaux sociaux.
Le tout dans un contexte de confusion entre ces auto-tests à domicile et la recherche sur les tests médicaux en conditions cliniques.

Des résultats trop peu fiables

Ces tests à la maison sont-ils fiables ? Une équipe de chercheurs ³ a voulu le vérifier en évaluant 7 services commerciaux. Pour cela, ils ont utilisé un échantillon fécal standardisé, habituellement employé par les laboratoires comme référence, et l’ont envoyé trois fois à chaque entreprise en utilisant chaque kit complet selon les consignes fournies, comme le ferait un consommateur avant l’envoi au laboratoire.
 

Le bilan devrait vous faire passer toute envie d’investir dans ces tests ! En effet, les failles sont nombreuses :

• les méthodes d’analyse diffèrent fortement entre les entreprises, et ce à toutes les étapes, des modalités de collecte de l’échantillon jusqu’à l’analyse informatique des résultats et l’évaluation de la composition du microbiote intestinal.
• les résultats varient fortement d’une entreprise à l’autre : un seul genre bactérien (Streptococcus) est retrouvé par toutes les entreprises. Dans certains cas, les différences sont du même ordre de grandeur que les variations naturelles observées entre individus ! Plus surprenant encore, une même entreprise peut obtenir des résultats différents à partir d’un même échantillon envoyé trois fois en analyse.
• quant à l’interprétation des résultats, chaque entreprise utilise ses propres bases de référence. Résultat : les conclusions peuvent varier d’un prestataire à l’autre… voire au sein d’une même entreprise, qui peut juger un même profil “sain” puis “non sain” lors de l’analyse suivante ! Avec à la clé des recommandations contradictoires pourtant présentées comme « personnalisées », dans le rapport remis au consommateur.

Appel à la prudence et à l’amélioration

Ces divergences posent un sérieux problème, avec des risques de retard de diagnostic de patients en quête de réponses, qui s’auto-soigneraient sur la base de fausses informations, notamment lorsqu’ils cherchent à mieux comprendre certaines maladies ou un désordre intestinal persistant.

Aussi, faute de pouvoir contenir la demande des consommateurs, les auteurs de l’étude appellent à plusieurs améliorations afin de ne pas faire d’un simple résultat de kit un outil de diagnostic médical :

• renforcer la qualité analytique des méthodes,
• faire preuve de prudence sur l’interprétation des résultats,
• proposer des lignes directrices communes à l’ensemble du secteur (des entreprises de tests à tous les éventuels partenaires impliqués).

Objectif : harmoniser les pratiques et restaurer la confiance des utilisateurs comme des autorités de santé.