La composición de la microbiota intestinal se asocia a la aparición, en el futuro, de la enfermedad de Crohn en familiares sanos de primer grado de pacientes enfermos

¿Qué se sabe ya sobre este tema?

La enfermedad de Crohn (EC) es una enfermedad inflamatoria del intestino (EIIC) caracterizada por una inflamación crónica y reincidente del intestino. Se desconoce la causa de la EC, pero la hipótesis actual es que hay factores microbianos o ambientales que inducen una inflamación del intestino en personas genéticamente predispuestas, lo que provoca inflamación y lesiones intestinales crónicas. Los estudios de casos y testigos de pacientes con enfermedad de Crohn han registrado alteraciones en la composición del microbioma intestinal [1]. Sin embargo, estos estudios no permiten determinar si la alteración de la composición del microbioma intestinal se asocia a la aparición de la enfermedad de Crohn o si es el resultado de una inflamación o de un tratamiento farmacológico. Para responder a estas preguntas, se diseñó el proyecto canadiense GEM (Genetic Environmental Microbial), un estudio de cohorte prospectiva de familiares de primer grado con buena salud de personas con enfermedad de Crohn, con el objetivo de identificar los parámetros asociados al desarrollo de la enfermedad de Crohn. Entre estos parámetros, los autores analizaron el perfil de la composición del microbioma intestinal que precede a la aparición de la EC, y en qué medida esta composición predice el riesgo de padecer EC. Los autores aplicaron un sistema de aprendizaje automático al análisis de la composición del microbioma intestinal en una amplia cohorte de voluntarios sanos familiares de primer grado de personas con enfermedad de Crohn (N = 3483), con el objetivo de definir una firma microbiana asociada al riesgo de padecer la EC.

¿Cuáles son los principales resultados aportados por este estudio?

A partir de los datos obtenidos de la cohorte GEM, los autores desarrollaron y validaron una puntuación de riesgo del microbioma (PRM) capaz de clasificar a las personas que padecerán EC en el futuro. Entre los taxones que más contribuyen a la PRM, el aumento en la abundancia de Ruminoccus torques y de Blautia se correlacionó positivamente con la PRM (lo que sugiere un efecto pernicioso de estos taxones), mientras que la abundancia del género Roseuria se correlacionó negativamente con la PRM (lo que sugiere un efecto protector de este género). Por último, los autores comprobaron que un aumento de la abundancia del género Faecalibacterium se asoció inversamente a un aumento de la PRM. Este estudio es el primero que demuestra que la disminución de la abundancia de Faecalibacterium puede ser una firma preclínica de la EC, que se puede observar mucho antes de la aparición de la enfermedad, lo que sugiere un papel causal de la disminución de esta bacteria antinflamatoria [2]. Es importante señalar que las alteraciones del microbioma que precedieron a la aparición de la EC se observaron independientemente de la existencia de una inflamación intestinal (medida por la calprotectina fecal).

Además, los autores hicieron un análisis metabolómico de las heces en un subconjunto de la cohorte. La citosina y su derivado, la citidina presentaban la mayor correlación negativa con la PRM.

Además, la firma previa a la EC de la PRM se asoció a una reducción de metabolitos con actividad antinflamatoria o antioxidante, como el gentisato y el nicotinato. Estos metabolitos protectores también estaban correlacionados positivamente con la abundancia de Faecalibacterium y de Lachnospira, lo que indica una interacción biológica potencial entre la abundancia de estos metabolitos y la composición microbiana.

¿Cuáles son las consecuencias en la práctica?

Este estudio sugiere que el análisis del microbioma de personas sanas con riesgo de padecer enfermedad de Crohn permitiría identificar a las personas con mayor riesgo, y así iniciar un seguimiento estrecho y, posiblemente, realizar acciones con el objetivo de modificar el desequilibrio microbiano para reducir el riesgo de padecer la enfermedad.