Виром и микобиом и их роль в развитии колоректального рака

Недавно ученые провели первые исследования грибкового и вирусного дисбактериоза кишечника у пациентов с колоректальным раком. Полученные результаты открывают новые перспективы диагностики и лечения.

Исследования колоректального рака (КРР) в основном направлены на изучение популяций бактерий, но теперь ученые стали рассматривать и другие микроорганизмы (грибы и вирусы). Группа ученых из Гонконга изучила специфику микобиома у пациентов с колоректальным раком. Проанализировав образцы кала 73 пациентов и 92 здоровых добровольцев, ученые обнаружили определенную грибковую подпись у пациентов с КРР – соотношение Basidiomycota:Ascomycota (двух наиболее распространенных представителей человеческого микобиома) увеличено, при этом численность и разнообразие грибов не изменены.

Оппортунистические и защитные дрожжи

В приведенном исследовании в стуле пациентов с КРР преобладали шесть родов грибов, в том числе ряд оппортунистических патогенов, таких как Acremonium (Ascomycota) и Rhodotorula (Basidiomycota). Ученые также обнаружили дрожжи Malassezia (Basidiomycota), которые обычно встречаются на коже и связаны с развитием атопического дерматита и других заболеваний. Следовательно, они могут колонизировать кишечник тем же способом, что и Candida albicans (Ascomycota). У пациентов с КРР было также повышено содержание некоторых видов Aspergillus, особенно A. flavus, который продуцирует афлатоксин и может обладать канцерогенными свойствами. И наоборот, содержание дрожжей Saccharomyces cerevisiae, которые колонизируют кишечную микробиоту и обладают противовоспалительными и иммуномодулирующими свойствами, у пациентов с КРР было снижено. По мнению авторов исследования, эти результаты могут лечь в основу нового терапевтического подхода. Ученые выявили аналогичные нарушения грибкового равновесия еще в двух когортах, а это значит, что полученные данные можно использовать в качестве диагностических биомаркеров.

Косвенная роль бактериофагов

Другая группа ученых из Северной Америки исследовала образцы стула 30 пациентов с раком, 30 пациентов с аденомой и 30 здоровых субъектов. Они обнаружили, что у пациентов с раком/аденомой разнообразие и численность вирусов не изменены, и раскрыли роль некоторых бактериофагов (в том числе из семейств Siphoviridae и Myoviridae) в развитии колоректального рака. По мнению ученых, некоторые бактериофаги разрушают популяции бактерий в толстой кишке и могут влиять на прогрессирование опухолей. Вызывая лизис бактериальных клеток, они помогают оппортунистическим видам закрепляться на эпителии кишечника и продуцировать биопленку, облегчающую проникновение в просвет кишечника онкогенных бактерий, которые запускают воспалительный ответ иммунной системы. Или... все же бактерии влияют на виром? Несмотря на множество предложенных гипотез, остается ряд вопросов, ответы на которые позволят расширить арсенал диагностических и терапевтических средств для борьбы с третьим по распространенности в мире видом рака по состоянию на 2018 год.