Les régimes alimentaires ciblant le microbiote intestinal modulent l'état immunitaire chez l'homme

Que sait-on déjà à ce sujet ?

Le lien entre l’alimentation et le microbiote chez l’homme a été démontré de nombreuses façons, notamment en corrélant les habitudes alimentaires et la diversité ou composition du microbiote [2]. D’autre part, les changements à court terme du régime alimentaire modifient rapidement le microbiote intestinal humain [3]. Le microbiote étant un acteur majeur dans la biologie humaine, sa manipulation, particulièrement via des interventions nutritionnelles, pourrait être un moyen puissant de modifier divers aspects de la santé. Une question essentielle est de savoir si des recommandations alimentaires générales (et non personnalisées) peuvent être énoncées à partir des interactions microbiote- hôte existantes pour améliorer la santé au sein des populations. De nombreuses maladies chroniques non transmissibles, dont la fréquence augmente rapidement avec l’industrialisation, sont liées à une inflammation chronique. De même, les modifications du microbiote intestinal liées à l’industrialisation sont également bien documentées. Étant donné l’influence du microbiote sur le statut inflammatoire, on peut imaginer qu’un régime alimentaire le ciblant pourrait atténuer l’inflammation systémique. Un grand nombre de publications soutiennent le rôle des fibres dans la santé, notamment via la stimulation de la diversité du microbiote et le rôle positif des acides gras à chaîne courte qui sont un produit de leur fermentation par le microbiote. L’enrichissement du régime alimentaire en fibres a un impact sur le microbiote et améliore des marqueurs de santé [4]. Ces résultats et l’insuffisance de la consommation de fibres dans le régime alimentaire occidental moyen suggèrent que l’apport de fibres pourrait être un moyen de moduler le système immunitaire humain via le microbiote. Plusieurs rapports suggèrent que les aliments fermentés, tels que le kombucha, le yaourt et le kimchi, pourraient avoir des bénéfices pour la santé, notamment sur le maintien du poids et la diminution des risques de diabète, de cancer et de maladies cardiovasculaires [5].

Quels sont les principaux résultats apportés par cette étude ?

Afin d’examiner l’effet de l’alimentation sur le microbiome et le système immunitaire, des adultes en bonne santé ont été recrutés pour participer à une intervention diététique de 10 semaines (18 sujets par groupe). Les participants ont reçu un régime riche en fibres (en moyenne, augmentation de 21,5 ± 8,0 g par jour à 45,1 ± 10,7 g par jour) ou un régime riche en aliments fermentés (en moyenne, augmentation de 0,4 ± 0,6 à 6,3 ± 2,9 portions par jour). De manière surprenante, le régime riche en fibres n’entraînait pas d’augmentation de la diversité du microbiote (Figure 1A), peut-être du fait d’une capacité insuffisante de dégradation des glucides par le microbiote des participants. En revanche, une augmentation de l’abondance des enzymes de dégradation des glucides végétaux était notée. Une diminution des acides gras à chaîne ramifiée (acide isobutyrique, isovalérique et valérique) était observée, sans qu’il soit possible de déterminer si cela était dû à une modification fonctionnelle du microbiote ou à une diminution de la consommation de produits laitiers et de viande bovine, qui contiennent des niveaux élevés de ces molécules. Un effet du régime sur le profil immunitaire était observé et dépendait du microbiote basal des participants.

Contrairement au régime riche en fibres, le régime riche en aliments fermentés induisait une augmentation de la diversité du microbiote (Figure 1B). Cette augmentation n’était pas principalement liée à la colonisation des bactéries probiotiques consommées, mais plutot à l’acquisition de nouvelles bactéries ou à l’expansion de certaines bacteries endogènes. Enfin, la consommation d’aliments fermentés conduisait à une diminution du niveau inflammatoire systémique avec la diminution de plusieurs cytokines, chimiokines et autres protéines sériques inflammatoires, dont l’interleukine (IL)-6, l’IL-10 et l’IL-12b.

Quelles sont les conséquences en pratique ?

Cette étude montre que l’alimentation a de profonds effets sur le microbiote intestinal et la physiologie de l’hôte, ce qui confirme son rôle dans la santé et son rôle potentiel dans la prévention des maladies. Un régime riche en fibres et enrichi en aliments fermentés ont des effets très différents. La meilleure définition des effets de l’alimentation sur le microbiote et la physiologie de l’hôte permettra la mise en place de stratégies préventives ou thérapeutique à l’échelle de la population, mais aussi à un niveau personnalisé.